记者9月15日从农业部获悉,从9月11日开始到年底，农业部要对包括转基因在内的科研项目管理开始新一轮的清查整顿，分五组调查2011-2014年的农业科研项目经费使用管理情况，重点是监督农业科研项目资金是否做到单独核算、专款专用,，有无扩大经费使用范围、预算外拨款、虚列支出、套取资金等违规、违纪、违法行为。

　　自去年以来,相关部委已多次就国家转基因项目经费使用情况进行检查，两个月前被曝光的中国农大院士李宁涉嫌挪用巨额转基因项目经费问题，就是其中之一。目前,清查仍在继续。李宁采取的违法手段，是将国家转基因专项经费，或者直接转移至自己的公司，或者转移到与别人合伙开办的企业。据消息人士透露，自2008年启动转基因生物新品种培育科技重大专项以来，国家财政最多的时候一年就有二三十亿元的预算，但却一直缺乏有效的监管，一些拥有院士级别的专家也在借机牟利。

　　分析称,预计像李宁一样，在主持转基因重大项目的同时，又兼公司老板或者参股企业的情况，将会受到严格清查、严格整顿；而过去主持转基因项目的院士的权力，也可能会被削弱。